E commerce is hot and happening. Na een gigantische piek tijdens Covid gevolgd door een kleine dip laat online verkoop in 2025 weer mooie groeicijfers zien. Eigenlijk een beetje tegen de verwachting in. Groeien met de online winkel betekent meer administratieve verplichting. Centraal daarom: De e commerce boekhouder: waarom een specialist voor jouw webshop onmisbaar kan zijn.
Wat doet een e-commerce boekhouder
Een e-commerce boekhouder is gespecialiseerd in de financiële administratie van webshops en online verkopers. Dit type boekhouder begrijpt hoe verkoopplatformen als Amazon, Bol, Shopify en WooCommerce werken, en kent de uitdagingen die hierbij komen kijken. Denk aan het verwerken van grote aantallen transacties, verschillende btw-tarieven per land en de koppeling met diverse payment service providers. Een goede e-commerce boekhouder zorgt dat jouw administratie niet alleen voldoet aan de wet- en regelgeving, maar ook dat je altijd overzicht houdt over je omzet, kosten en marge per kanaal.
Het verschil tussen een normale boekhouder en een e-commerce boekhouder
Waar een traditionele boekhouder gewend is aan facturen, bonnetjes en bankmutaties van fysieke winkels of dienstverleners, werkt een administratief e-commerce expert dagelijks met exportbestanden uit platforms, payment reports van aanbieders als Mollie, Stripe of PayPal, en complexe retourstromen. Een normaal boekhoudkantoor mist vaak de kennis om data uit deze bronnen goed te interpreteren. Denk aan de manier waarop Amazon bijvoorbeeld uitbetalingen splitst, verschillende soorten fees hanteert, en hoe omzet en retouren gescheiden worden. Een boekhouder voor ecommerce weet precies hoe deze stromen werken en voorkomt zo dat omzet dubbel wordt geboekt, retouren verkeerd verwerkt worden, of voorraadwaardes niet kloppen.
Wanneer heb je een gespecialiseerde e-commerce boekhouder nodig, en wanneer niet
Niet elke webshop heeft direct een e-commerce boekhouder nodig. Heb je een eenvoudige online winkel met weinig transacties, een beperkt aantal producten en verkoop je alleen in Nederland? Dan kan een reguliere boekhouder in veel gevallen voldoen. Zodra je echter verkoopt via meerdere platformen, internationaal actief bent, of duizenden transacties per maand verwerkt, wordt het al snel ingewikkeld. De kans op fouten neemt toe, en het is dan verstandig om over te stappen op een boekhouder e commerce. Ook wanneer je merkt dat je huidige boekhouder veel vragen stelt over je platformdata, of steeds moet uitzoeken hoe het precies zit met bijvoorbeeld Amazon-uitbetalingen, is het tijd om over te stappen op een specialist.
De uitdagingen voor de administratie van een online business
- Omzet en kosten verwerken bij meerdere platformen
Een van de grootste uitdagingen voor een ecommerce boekhouder is het overzichtelijk en juist verwerken van omzet uit verschillende bronnen. Denk aan verkopen via je eigen webshop, maar ook via marketplaces als Amazon of Bol. Iedere partij hanteert eigen rapportages, betaalcycli en fee-structuren. Een goede boekhouder webshop weet hoe je deze omzetstromen samenvoegt, zonder dubbelingen of missende bedragen. Daarnaast moet er rekening gehouden worden met de bijbehorende kosten, zoals commissies, verzendkosten en promotiekosten die per platform verschillen. - Retouren en refunds goed inboeken
Retouren zijn in de e-commerce eerder regel dan uitzondering. Het correct verwerken van retouren en refunds is essentieel voor een kloppende administratie. Niet alleen omdat het je marge beïnvloedt, maar ook omdat je anders onterecht btw afdraagt of je voorraad niet klopt. Een ervaren boekhouder ecommerce heeft duidelijke processen voor het registreren van retouren, herbevoorrading en terugbetalingen, zodat je altijd weet waar je aan toe bent. - Betalingen matchen via Amazon, PayPal, Mollie, Stripe, Shopify Payments, etc.
Veel e-commerce ondernemers herkennen het probleem: je krijgt uitbetalingen van Amazon, Stripe, PayPal, Mollie, Shopify Payments en soms nog andere betaalproviders. Maar waar komt dat bedrag precies vandaan? Vaak bestaat een uitbetaling uit honderden transacties, minus verschillende fees en retouren. Het is belangrijk om niet simpelweg het uitbetaalde bedrag als omzet te boeken. Een gespecialiseerde e-commerce boekhouder gebruikt niet het payment report, dat vaak onderaan letterlijk meldt dat het “niet voor boekhoudkundige doeleinden is”, maar gaat terug naar de brondata om alles nauwkeurig te matchen. Dit voorkomt fouten in je omzetcijfers, en zorgt dat btw en marges juist worden verwerkt. - Voorraadwaarde in je boekhouding verwerken
Naast omzet en betalingen is de juiste verwerking van je voorraad cruciaal. Zeker als je verkoopt via meerdere kanalen of met fulfillment werkt, kan je voorraad snel fluctueren. Een boekhouder voor webshop zorgt ervoor dat de waarde van je voorraad op elk moment klopt, dat afschrijvingen correct worden geboekt, en dat je direct inzicht hebt in je winstgevendheid per productgroep. Dit voorkomt onaangename verrassingen bij de jaarafsluiting en is essentieel voor een gezonde bedrijfsvoering.
Stappenplan: een specialistische boekhouder voor webshops of niet
Breng je verkoopkanalen in kaart: verkoop je op één platform of op meerdere, zoals Amazon, Bol, Shopify of WooCommerce?
Bepaal het aantal transacties: heb je enkele tientallen transacties per maand, of loopt het in de honderden of duizenden?
Kijk naar je betaalstromen: ontvang je uitbetalingen via verschillende betaalproviders (bijvoorbeeld Mollie, Stripe, PayPal) en zie je door de bomen het bos niet meer?
Hoe verwerk je retouren: gebeurt dit handmatig, en merk je dat er fouten ontstaan, of gaat het geautomatiseerd en overzichtelijk?
Ben je internationaal actief: moet je rekening houden met buitenlandse btw, OSS-regelingen of EPR-rapportages?
Heb je overzicht op je voorraadwaarde: weet je precies wat je op voorraad hebt en hoe dat in je boekhouding verwerkt wordt?
Ervaar je regelmatig vragen of onduidelijkheid bij je huidige boekhouder over e-commerce gerelateerde onderwerpen?
Zie je fouten of afwijkingen in je maand- of jaarcijfers die je zelf niet goed kunt herleiden?
Als je op meerdere van deze punten ‘ja’ antwoordt, is het verstandig om over te stappen naar een e-commerce boekhouder.
Vergelijking: traditionele boekhouder versus e-commerce boekhouder
Een traditionele boekhouder richt zich vooral op standaard administraties: facturen, bonnetjes en afschrijvingen. Bij een boekhouder e commerce draait alles om data-integratie, geautomatiseerde import van transacties, en het correct verwerken van complexe retour- en betaalstromen. Een traditionele boekhouder kan vaak niet goed overweg met de csv-export van Amazon of Bol, en boekt soms simpelweg het uitbetaalde bedrag als omzet. Hierdoor ontstaan fouten, zoals het dubbel boeken van omzet, vergeten van retouren, of onterecht afgedragen btw. De ecom boekhouder gebruikt gespecialiseerde tools en heeft ervaring met platformen, waardoor je als ondernemer tijd en frustratie bespaart én zeker weet dat je cijfers kloppen.
Peter van de Rijdt, mede-oprichter van Staxxer, ziet in de praktijk regelmatig administraties van e-commerce ondernemers die zijn samengesteld door traditionele boekhouders. “Wij zien te vaak administraties waarbij de traditionele boekhouder eigenlijk niet goed weet wat ze met al die e-commerce transacties van verschillende platformen moeten doen. Er worden dan fouten gemaakt, bijvoorbeeld doordat het payment report wordt gebruikt als basis voor de boekhouding, terwijl daar letterlijk onder staat: ‘deze informatie is niet voor boekhoudkundige doeleinden’. Dit leidt tot onjuiste cijfers, gemiste btw-correcties bij de Belastingdienst en onduidelijkheid voor de ondernemer.”
Met de juiste kennis en juiste tools is de complexiteit te overkomen. De vraag die rest is, wie gaat die juiste tools installeren en kennis vergaren?
Conclusie: zo maak je de juiste keuze voor jouw webshop
De keuze voor een e-commerce boekhouder hangt af van de complexiteit en omvang van jouw onderneming. Heb je te maken met meerdere verkoopkanalen, veel transacties, verschillende betaalstromen en retouren, of internationale verplichtingen? Dan is een gespecialiseerde boekhouder voor e-commerce geen overbodige luxe, maar bijna een vereiste. Door te kiezen voor een boekhouder die ervaring heeft met de e-commerce sector, voorkom je fouten, boetes en frustratie. Bovendien houd je zelf tijd over voor ondernemen.

